醫(yī)院占地面積3.7萬(wàn)平方米，建筑面積13.6萬(wàn)平方米，開(kāi)放床位1934張。建成23個(gè)國(guó)家、省市臨床重點(diǎn)專(zhuān)科，其中國(guó)家臨床重點(diǎn)專(zhuān)科2個(gè)（骨科、神經(jīng)外科）、廣東省高水平臨床重點(diǎn)專(zhuān)科6個(gè)（骨科、神經(jīng)外科、耳鼻咽喉科、燒傷科、重癥醫(yī)學(xué)科、口腔科）、廣東省中醫(yī)重點(diǎn)專(zhuān)科1個(gè)、深圳市臨床重點(diǎn)專(zhuān)科/專(zhuān)病11個(gè)、深圳市中醫(yī)特色專(zhuān)科3個(gè),并獲批13個(gè)國(guó)家、省級(jí)專(zhuān)科護(hù)士培訓(xùn)基地，牽頭7個(gè)深圳市質(zhì)控中心，引進(jìn)3個(gè)國(guó)外“孔雀計(jì)劃”團(tuán)隊(duì)、先后引進(jìn)35個(gè)“三名工程”團(tuán)隊(duì)。 在最新公布的2021年度醫(yī)院科技量值（STEM）綜合排名位列全國(guó)94名，12個(gè)學(xué)科進(jìn)入2021年度全國(guó)百?gòu)?qiáng)，13個(gè)學(xué)科進(jìn)入五年總科技量值（ASTEM）全國(guó)百?gòu)?qiáng)。連續(xù)六年（2016-2021）進(jìn)入全國(guó)醫(yī)療機(jī)構(gòu)自然科學(xué)指數(shù)百?gòu)?qiáng)行列，2021年排名57。連續(xù)四年（2019年-2022年）進(jìn)入ESI全球機(jī)構(gòu)前1%。2022年7月29日，由中醫(yī)學(xué)創(chuàng)新聯(lián)盟（CMIA）聯(lián)合海南博鰲醫(yī)學(xué)創(chuàng)新研究院等機(jī)構(gòu)推出的國(guó)內(nèi)首個(gè)《中國(guó)醫(yī)院創(chuàng)新轉(zhuǎn)化排行榜》隆重發(fā)布，深圳市第二人民醫(yī)院綜合排名全國(guó)第20位，位列廣東省第1。2018-2021年，連續(xù)四年在全國(guó)三級(jí)公立醫(yī)院績(jī)效考核等級(jí)為 A+，穩(wěn)居全國(guó)百?gòu)?qiáng)。