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廣東省微生物研究所前身為中科院中南真菌研究室，于1964年5月19日經(jīng)國家科委批準(zhǔn)成立，1972年改為現(xiàn)名，隸屬于廣東省科學(xué)院。擁有2013年5月獲批的省部共建華南應(yīng)用微生物國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、1987開始建設(shè)并運(yùn)行的廣東省菌種保藏與應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和2005年建設(shè)的廣東省微生物應(yīng)用新技術(shù)公共實(shí)驗(yàn)室；依托該所的廣東省食品安全檢測與評價(jià)科技創(chuàng)新平臺(tái)已經(jīng)搭建；在廣東省材料檢測與評價(jià)科技創(chuàng)新平臺(tái)中建設(shè)的生態(tài)毒理和生物安全評價(jià)實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)完成全部建設(shè)內(nèi)容并投入運(yùn)營；廣州國家生物產(chǎn)業(yè)基地生物新技術(shù)及產(chǎn)品研究開發(fā)和測試公共實(shí)驗(yàn)中心已獲國家發(fā)改委立項(xiàng)支持，并于2011年完成驗(yàn)收投入使用。廣東省微生物學(xué)會(huì)、廣東省食用菌行業(yè)協(xié)會(huì)、廣東省生物技術(shù)生產(chǎn)力促進(jìn)中心、廣東省食用菌產(chǎn)品質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)站均掛靠該所。研究所的重點(diǎn)科研領(lǐng)域?yàn)槲⑸镔Y源多樣性與前期開發(fā)、微生物生態(tài)與環(huán)境污染控制、微生物危害及其檢測與控制、微生物分子育種及生物轉(zhuǎn)化、食藥用菌生物技術(shù)與人類健康五個(gè)方面。目前所內(nèi)已形成資源微生物學(xué)、環(huán)境微生物學(xué)、分析微生物學(xué)和霉腐微生物學(xué)等四個(gè)優(yōu)勢學(xué)科，具有博士研究生和碩士研究生培養(yǎng)能力，2010年獲人力資源和社會(huì)保障部批準(zhǔn)建設(shè)博士后科研工作站。廣東省微生物研究所的科技業(yè)務(wù)工作主要有科技創(chuàng)新、行業(yè)共性關(guān)鍵技術(shù)及科技服務(wù)和成果轉(zhuǎn)移與轉(zhuǎn)化三個(gè)方面，其中科技創(chuàng)新主要依托省部共建華南應(yīng)用微生物國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、廣東省菌種保藏與應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和廣東省微生物應(yīng)用新技術(shù)公共實(shí)驗(yàn)室；行業(yè)共性關(guān)鍵技術(shù)及科技服務(wù)主要依托廣東省微生物分析檢測中心、廣東省食用菌產(chǎn)品質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)站和國家廣州化學(xué)品生態(tài)環(huán)境安全評價(jià)服務(wù)中心；成果轉(zhuǎn)移與轉(zhuǎn)化載體主要依托廣州國家生物產(chǎn)業(yè)基地生物新技術(shù)及產(chǎn)品研究開發(fā)和測試公共實(shí)驗(yàn)中心以及食用菌研究發(fā)展中心、微生物檢測新技術(shù)研究發(fā)展中心、微生物工程研究發(fā)展中心及環(huán)境微生物研究發(fā)展中心等四個(gè)科研、開發(fā)、推廣應(yīng)用一體化的研究發(fā)展中心。依托于我所的廣東省菌種保藏與應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室在2000年、2003年、2006年和2010年連續(xù)四次被評為廣東省優(yōu)秀重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室；廣東省微生物應(yīng)用新技術(shù)公共實(shí)驗(yàn)室2008年以優(yōu)異成績通過廣東省科技廳的驗(yàn)收；在廣東省菌種保藏與應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和廣東省微生物應(yīng)用新技術(shù)公共實(shí)驗(yàn)室的基礎(chǔ)上組建的廣東省華南應(yīng)用微生物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室2009年獲科技部批準(zhǔn)組建省部共建國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室培育基地，2012年4月通過科技部組織的專家驗(yàn)收，2013年3月通過科技部組織的專家論證，成功晉升為省部共建華南應(yīng)用微生物國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。目前實(shí)驗(yàn)室擁有實(shí)驗(yàn)面積4750平方米，包括公共實(shí)驗(yàn)室、大型儀器室、華南微生物資源中心（包括標(biāo)本庫和菌種保藏中心）、環(huán)境微生物實(shí)驗(yàn)室、微生物檢測與控制實(shí)驗(yàn)室、霉腐微生物實(shí)驗(yàn)室、食藥用菌生理功能及分子機(jī)理實(shí)驗(yàn)室、工業(yè)化前期實(shí)驗(yàn)室等；擁有各類儀器設(shè)備236臺(tái)套，儀器設(shè)備原值3680萬元，其中30萬元以上設(shè)備36臺(tái)套，包括流式細(xì)胞儀、透射電子顯微鏡、掃描電子顯微鏡、激光共聚焦顯微鏡、全自動(dòng)發(fā)酵罐、凝膠成像儀、各類PCR儀、超高效液相色譜儀、微生物電解呼吸儀、質(zhì)譜聯(lián)用儀、氣相色譜儀、電感耦合等離子體質(zhì)譜儀、高性能三重串聯(lián)四級桿液質(zhì)聯(lián)用系統(tǒng)、石墨爐原子吸收光譜儀、高速冷凍離心機(jī)、全自動(dòng)微生物鑒定系統(tǒng)等，以上設(shè)備大部分是2008年以來購置，整體儀器設(shè)備達(dá)到國際先進(jìn)水平，以上實(shí)驗(yàn)室及設(shè)備完全具備了分子水平、細(xì)胞水平及基因水平的研究要求。建所以來，在科研項(xiàng)目方面，先后承擔(dān)了國家973計(jì)劃項(xiàng)目、國家“863”計(jì)劃項(xiàng)目、國家重大科技攻關(guān)項(xiàng)目、國家科技支撐項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目、農(nóng)科成果轉(zhuǎn)化項(xiàng)目、國家科技型中小型企業(yè)技術(shù)創(chuàng)新基金項(xiàng)目、國家生物高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)化示范工程項(xiàng)目、廣東省教育部產(chǎn)學(xué)研項(xiàng)目、粵港招標(biāo)項(xiàng)目和省基金團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目、省科技創(chuàng)新百項(xiàng)工程項(xiàng)目、省自然科學(xué)基金項(xiàng)目、省重大重點(diǎn)科技攻關(guān)項(xiàng)目及科技援藏項(xiàng)目、廣州市重大重點(diǎn)科技項(xiàng)目等重大重點(diǎn)科技項(xiàng)目；在標(biāo)準(zhǔn)制定方面，主持和參與七十多個(gè)國家、行業(yè)和地方標(biāo)準(zhǔn)制修訂項(xiàng)目；在科技成果方面，共取得科技創(chuàng)新成果142項(xiàng)，其中國際先進(jìn)、領(lǐng)先水平的60項(xiàng)；獲得國家及省部級成果獎(jiǎng)108項(xiàng)，其中國家級成果獎(jiǎng)6項(xiàng)、省部級一等獎(jiǎng)12項(xiàng)；在專利申請方面，共申請專利287件，其中發(fā)明專利272件，授權(quán)專利162件，其中發(fā)明專利147件。在國內(nèi)外核心學(xué)術(shù)刊物發(fā)表論文1800多篇，出版科技專著36部。